1、负责范围不同
国家税务总局主管税收工作。
工商行政管理局主管政府主管市场监管和负责行政执法。
2、职能不同
工商局职能：
（一）负责市场监督管理和行政执法的有关工作，草拟有关法律、法规，制定工商行政管理规章制度。
（二）负责各类企业、农民专业合作社、从事经营活动的单位和个人，以及外国（地区）企业和其他市场实体常驻代表机构的登记和监督，并承担有关登记和监督工作。负责依法查处无证经营活动。
（三）依法承担规范和维护各类市场经营秩序的责任，监督管理市场交易和网上商品交易及其相关服务。
（四）承担流通领域商品质量监督管理职责，组织实施服务领域消费者权益保障工作，对假冒伪劣商品的违法行为依法查处。分工指导消费者咨询、申诉、举报受理、处理和网络体系建设工作，维护经营者和消费者的合法权益。
（五）负责查处非法直销、传销案件，依法对直销企业、传销人员及其直销活动进行监督管理。
（六）负责垄断协议的反垄断执法工作，滥用市场支配权，滥用行政权力排除竞争限制（不含价格垄断）。对不正当竞争、商业贿赂、走私走私等经济违法行为，依法查处。
（七）依法负责对经纪人、经纪机构和经纪活动的监督管理。
（八）依法对合同实施行政监督管理，负责动产抵押物登记，组织拍卖活动的监督管理，依法查处合同诈骗等违法行为。
（九）指导广告业的发展，负责广告活动的监督管理。
（十）负责商标注册和管理，保护商标专用权，依法查处商标侵权行为，处理商标纠纷，加强对驰名商标的认定和保护。电子马克。负责特殊和官方标志的登记、归档和保护。
（十一）组织、指导企业、个体工商户、商品交易市场的信贷分类管理，依法研究、分析、公布市场参与者的基本注册信息和商标注册信息，提供信息。为政府决策和公众提供服务。
（十二）负责对个体工商户、私营企业的经营活动进行服务和监督。
（十三）开展工商行政管理国际合作与交流。
（十四）领导全国工商行政管理工作。
（十五）办理国务院交办的其它事项。
税务局职能：
（一）拟订具体的税收法律、法规和实施细则，提出税收政策建议，并会同财政部报告和发布，制定实施办法。负责解释实施过程中税收法律法规和一般税收问题的征收管理，并在实施后报财政部备案。
（二）负责组织实施中央税务、共享税和法律、法规规定的资金（费）的筹集和管理，努力实现应收账款的足额征收。
（三）参与宏观经济政策研究、中央和地方分税制研究，提出完善税收分配制度的建议，研究税收负担的总体水平，提出税收宏观调控的建议。
（四）负责组织实施税收征管体制改革，起草税收征管法律、法规草案，制定和监督税收征管规章制度，监督检查税收征管实施情况。贯彻执行税收法律、法规和政策，指导和监督地方税务工作。
（五）负责规划和组织实施税收服务体系建设，制定税收服务管理制度，规范税收服务行为，制定和监督纳税人权益保护制度的实施，保护纳税人的合法权益。
纳税人的合法权益，履行为纳税人提供方便、优质、高效的税务服务的义务，组织实施税务宣传制定。注册税务人员管理政策并监督执行。
（六）组织实施纳税人分类管理和专项服务，组织实施大型企业的税务服务和源头管理。
（七）负责编制中长期税收计划和年度计划，进行税源调查，加强税收分析预测，组织税收减免等具体事项。
（八）负责制定税收征管信息系统，制定税收征管信息建设中长期规划，组织实施黄金税务项目建设。
（九）开展税收领域的国际交流与合作，参加国家（地区）之间的税收关系谈判，草拟和执行有关协定、协定。
（十）办理进出口商品的税收征管和出口退税业务。
（十一）实行国家税务制度垂直管理，配合省人民政府对省地方税务局实行双重领导，对省地方税务局局长的任免提出建议。
（十二）办理国务院交办的其它事项。
3、机构设置不同
工商局：
办公厅、 法规司、 反垄断与反不正当竞争执法局、 直销监督管理局、消费者权益保护局、市场规范管理司、 企业注册局、外商投资企业注册局、 广告监督管理司
个体私营经济监督管理司 、人事司 、国际合作司（港澳台办公室）、 机关党委、 离退休干部办公室、商标局、商标评审委员会、 纪检组、监察局。
税务局：
办公厅、政策法规司、货物和劳务税司、所得税司、财产和行为税司、国际税务司、收入规划核算司、纳税服务司、征管和科技发展司、大企业税收管理司、稽查局、财务管理司、督察内审司、人事司、机关党委、离退休干部办公室、巡视工作办公室。
参考资料来源：百度百科-国家税务总局
参考资料来源：百度百科-工商行政管理局
工商局：代表国家对企事业单位、社团组织进行登记和注册、对其的经营活动进行规范和管理，同时具有执法权。凡涉及流通领域的假冒伪劣，都是工商执法的对象。另外，商标注册也属工商管理。
国税局：所征收的税款由国家支配。增值税、生产企业的营业税等属于国税范畴。
地税局：所征收的税款由地方支配。所得税、服务业的营业税等属于地税范畴。
国税局纳税的意义：
纳税是国家组织财政收入的法律保障。
是国家宏观调控的有利手段。
对维护经济秩序有重要作用。
能维护国家权益，是促进国际经济交往的可靠保证。
区别:工商局进行工商执法,税务局进行征税。
工商局:代表国家对企事业单位、社团组织进行登记和注册、对其的经营活动进行规范和管理,同时具有执法权。凡涉及流通领域的假冒伪劣,都是工商执法的对象。另外,商标注册也属工商管理。
没有“税务局”,只有国税局和地税局。
国税局:所征收的税款由国家支配。增值税、生产企业的营业税等属于国税范畴。
地税局:所征收的税款由地方支配。所得税、服务业的营业税等属于地税范畴.
工商局主要职责
(一)负责市场监督管理和行政执法的有关工作,起草有关法律法规草案,制定工商行政管理规章和政策。
(二)负责各类企业、农民专业合作社和从事经营活动的单位、个人以及外国(地区)企业常驻代表机构等市场主体的登记注册并监督管理,承担依法查处取缔无照经营的责任。
(三)承担依法规范和维护各类市场经营秩序的责任,负责监督管理市场交易行为和网络商品交易及有关服务的行为。
(四)承担监督管理流通领域商品质量责任,组织开展有关服务领域消费维权工作,按分工查处假冒伪劣等违法行为,指导消费者咨询、申诉、举报受理、处理和网络体系建设等工作,保护经营者、消费者合法权益。
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